本處為推展營運與管理，統籌調配水源，另設置23個灌溉工作站，負責執行灌溉管理及設施維護等業務。

管理處功能為農田水利興辦

一、農田水利事業之興辦、改善、保護及管理事項。

二、農田水利事業災害之預防及搶救事項。

三、農田水利事業經費之籌措及基金設立事項。

四、農田水利事業效益之研究及發展事項。

五、配合政府推行土地、事業、工業政策與農村建設事項。

六、主管機關依法交辦事項。

一、農田水利用水調配及管理。

二、灌溉用水秩序維護及水利小組業務輔導。

三、農田水利設施興建、管理、改善及維護。

四、農田水利設施災害預防及搶救。

五、灌溉管理組織內專任職員（以下簡稱農田水利事業人員）之人事管理。

六、農田水利事業作業基金所屬資產管理及收益。

七、主管機關及農業部農田水利署交辦事項。